Les missions du poste

L'analyse d'images biologiques est un domaine scientifique multidisciplinaire qui s'appuie sur les mathématiques, le traitement du signal et la physique, pour extraire des informations exhaustives à partir d'images grâce à des programmes informatiques. La recherche à l'Unité d'Analyse d'Images Biologiques est consacrée à la conception de méthodes computationnelles innovantes pour aborder des questions biologiques complexes par le biais d'approches quantitatives rigoureuses.

Nos projets de recherche touchent aux domaines de l'apprentissage automatique, de l'imagerie mathématique, de l'analyse statistique, de la classification de formes et de la biophysique computationnelle des cellules. Ils portent sur l'analyse spatiale des biomolécules, la dynamique des organites subcellulaires, la mécanobiologie de la motilité cellulaire, l'orchestration spatio-temporelle du trafic cellulaire et d'agents pathogènes, l'analyse du comportement social chez les souris et la pathologie numérique. Nos méthodes vont du flux optique augmenté biophysiquement aux modèles de contours actifs, en passant par les statistiques spatiales et l'apprentissage profond.

🎯 Missions :

Vous êtes intéressé(e) par le développement d'applications associées à la biologie et à l'analyse d'images ? Vous souhaitez apprendre et travailler de bout-en-bout sur un projet interdisciplinaire ?

Alors vous pouvez intégrer notre équipe et serez formé(e) sur les projets suivants :
- Développement de plugins en Java et Python pour l'analyse d'images dans une application scientifique qui est destinée aux chercheurs en Sciences de la Vie (Icy, https://icy.bioimageanalysis.org/)
- Développement Full-Stack du site d'Icy (BDD, API/Back et Front, le tout avec Docker)
- Documentation technique pour développeurs et utilisateurs finaux.

Vous travaillerez en équipe avec les ingénieurs et chercheurs qui développent le logiciel Icy, au sein de l'Institut Pasteur.